Основной направлением научных исследований лаборатории является исследование почв как природных ресурсов, имеющих самостоятельную потребительскую ценность наравне с другими природными ресурсами — недрами, лесом, водой, атмосферным воздухом и др.

Ценность почвенных ресурсов при этом определяется их потребительскими качествами в зависимости от конкретной эксплуатационной или технологической задачи. В связи с этим одной из главных целей лаборатории выступает разработка методов и способов проведения экологической и экономической оценки и экспертизы почв под различные эксплуатационные задачи.

Выполнение данной цели осуществляется путем разработки теоретических подходов, базирующихся на концепции структурно-функциональной роли почв в биосфере и наземных экосистемах, разработки концепции почвенных ресурсов, а также основывается на опыте выполнения различных почвенно-экологических экспертиз и анализе возникающих типовых ситуаций.